摺耳貓的摺耳形狀來自一種顯性基因突變（FDF gene），這種基因影響了軟骨的正常發育：
摺耳貓的耳朵之所以凹折，是因為基因缺陷導致的骨軟骨發育不全。既然是基因導致，多半不會單單只發生在耳朵，而是全身的軟骨都可能出現病變，很可能造成貓貓大半輩子的疼痛
發病後的病徵包括關節疼痛、骨刺、後肢僵硬、腳趾畸形，指甲肥厚、倒插、無法伸縮。除了骨骼相關病症，摺耳貓的常見問題還有：
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1、呼吸道狹窄使呼吸不順
2、耳軟骨異常，耳道較容易發炎，甚至失聰。
3、癲癇
4、心肌肥大
5、先天性多囊腎
6、體質較虛弱
摺耳貓的骨骼病變是不可逆且無法根治的，通常等病徵出現時才會發現，只能以藥物緩解惡化速度、減輕疼痛。當病情惡化，貓咪就會行走困難，甚至癱瘓。
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因此除了定期健康檢查，飼主通常也都會視情況使用心臟及關節的保健品，在保養品及醫藥費的花費往往也是一筆負擔。因此，在迎接可愛的貓咪回家時，請別忘了幫祂們做好遺傳性基因檢查喔！
